定期对太阳能除垢，防止管路阻塞；并对水箱进行清洗，保证水质清洁。排污时，只要在保证进水正常的情况下，打开排污阀门，到排污阀流出清水就行了。
定期清除太阳能真空集热管上的灰尘污垢，保持真空管表面的清洁以保证较高的透光率。
注意检查真空管是否损坏，如有破损应及时更换。
要经常检查真空管的真空度或内玻璃管是否破碎，当真空管的钡——钛吸气剂变黑，即表明真空度已下降，需更换集热管。
太阳热水器除了清洗真空管外，还应同时清洗反射板。
检查各管道阀门浮球阀电磁阀连接胶管等有无渗漏现象，如有则应及时修复。
防止空晒。太阳能水箱和真空管内无水为空晒，将会造成内部温度升高，损坏涂层，使箱体保温层变形玻璃破裂等现象。
安装有辅助热源的全天候热水系统，应定期检查辅助热源装置及换热器工作正常与否。 对于辅助热源是电热管加热的，使用之前一定要确保漏电保护装置工作可靠，否则不能使用。对于热泵－太阳能供热系统，还应检查热泵压缩机和风机工作是否正常，无论哪部分出现问题都要及时排除故障。
冬季气温低时，应排空太阳能水箱内的水；安装有防冻控制系统功能的强制循环系统，则只需启动防冻系统即可，不必排空系统内的水。